• Cts. Eki 16th, 2021

İstanbul Haberleri

İstanbul Haberlerinin Yayımlandığı Yerel Gazete

Arkaik insanların genomlarına yeni bir bakış açısı

Genom tek başına şefsiz bir tarif gibidir - önemli bilgilerle doludur, ancak yorumlanması gerekir.

Genom tek başına şefsiz bir tarif gibidir – önemli bilgilerle doludur, ancak yorumlanması gerekir. Bu nedenle, nesli tükenmiş en yakın akrabalarımızın Neandertaller ve Denisovalıların genomlarını sıralamamış olsak da, genomlarımızdaki farklılıkların fiziksel özelliklerde gerçekte nasıl farklılıklara yol açtığına dair pek çok bilinmeyen var.

David Gokhman, “Arkaik genomlara baktığımızda, RNA veya hücre yapısı gibi genomdaki düzenlemeyi yorumlamamıza yardımcı olan günümüz bireylerinden alınan örneklerde genellikle sahip olduğumuz tüm katmanlara ve işaretlere sahip değiliz” dedi. , Stanford Üniversitesi’nde biyoloji alanında doktora sonrası araştırmacı.

“Sadece çıplak DNA dizilimine sahibiz ve gerçekten yapabileceğimiz tek şey ona bakmak ve bir gün bunun ne anlama geldiğini anlayabileceğimizi ummak,” dedi.

Bu umutlardan motive olan Stanford ve California Üniversitesi, San Francisco’daki (UCSF) bir araştırma ekibi, aramızdaki genomik farklılıkların fiziksel sonuçlarını potansiyel olarak ortaya çıkarmak için arkaik insanların genomlarından daha fazla bilgi toplamak için yeni bir yöntem geliştirdi. onları.

22 Nisan’da eLife’ta yayınlanan çalışmaları, gen ekspresyonuyla ilgili dizilere odaklandı – genlerin etkinleştirildiği veya susturulduğu, DNA’nın talimatlarının ne zaman, nasıl ve nerede takip edileceğini belirleyen süreç. Gen ifadesi, yakından ilişkili gruplar arasındaki fiziksel farklılıkları belirleyen genetik ayrıntı olma eğilimindedir.

Araştırmacılar, modern insanlara özgü 14.042 genetik varyanttan başlayarak, özellikle modern ve arkaik insanlar arasındaki gen ekspresyonundaki farklılıklara katkıda bulunan 407 buldular. Daha ileri analizlerde, farklılıkların, beynimizin duyusal bilgileri alan ve yürüme, koordinasyon, denge ve konuşma dahil olmak üzere istemli hareketi kontrol eden bölümü olan ses yolu ve beyincikle ilişkili olma olasılığının daha yüksek olduğunu belirlediler.

Beşeri Bilimler ve Bilimler Fakültesi’nden Michelle ve Kevin Douglas Profesörü Dmitri Petrov, “Elimizdeki bilgilerden ‘Ses kutusu gelişti’ gibi bir arama yapabilmeniz o kadar mantıksız görünüyor ki,” dedi. Makalenin kıdemli yazarı Gokhman ve UCSF’de biyomühendislik profesörü Nadav Ahituv ile birlikte. “Tahminler neredeyse bilim kurgu. Beş yıl önce biri bana bunun mümkün olacağını söyleseydi, ona fazla para koymazdım.”

Modern insanlara giden yol

İncelenecek çok sayıda varyantla, araştırmacılar, hangi dizilerin gerçekte gen regülasyonunu etkilediğini test etmek için “büyük ölçüde paralel muhabir tahlil” adı verilen bir tekniğe güvendiler. Bu tekniğin Ahituv tarafından geliştirilen versiyonu, DNA sekans varyantının bir virüs içindeki “raportör gen” olarak paketlenmesini içerir. Bu virüs daha sonra bir hücreye konur. Bu varyant gen ekspresyonunu etkiliyorsa, haberci gen, hangi DNA sekansından geldiğini tanımlayan barkodlu bir molekül üretir. Barkod, araştırmacıların çok sayıda varyantın ürünlerini aynı anda taramasına olanak tanır.

Esasen, tüm süreç, her bir varyantın gerçek hayatta bir hücrede nasıl oynayacağının kısaltılmış bir versiyonunu taklit eder ve sonuçları rapor eder.

UCSF’de yüksek lisans öğrencisi ve makalenin ortak baş yazarı Lana Harshman, ekibin değişken paketleriyle üç tür hücreyi enfekte etti. Bu hücreler, beyin, iskelet ve erken gelişimle ilgiliydi – bizim ve en yeni atalarımız arasındaki evrimsel farklılıkları ortaya çıkarması en muhtemel konular. Petrov laboratuvarında doktora sonrası araştırmacı ve makalenin ortak baş yazarı Carly Weiss, bu deneylerin sonuçlarını analiz etti.

Araştırmacılar toplamda, modern insanlarda, öncekilere kıyasla ifadede bir değişikliği temsil eden 407 sekans buldular. Bu liste arasında beyincik ve ses kutusu, yutak, gırtlak ve ses tellerini etkileyen genleri etkileyen genler fazla temsil ediliyor gibi görünüyor.

Gokhman, “Bu, bu organların hızlı bir şekilde evrimleştiğini veya modern insanlara özgü bir tür yol olduğunu gösterir” dedi. Bir sonraki adımın, bu diziler ve modern insanların evriminde oynadıkları roller hakkında daha fazla anlamaya çalışmak olduğunu ekledi.

Petrov, bu bilinmeyenlerle bile, bu tekniğin tek başına evrimsel araştırmalar için önemli bir ilerleme olduğunu söyledi.

Petrov, “Bu, Neandertal ve Denisovan kemiklerinden DNA’nın sıralanmasının ötesine geçiyor. Bu, bu farklılıklara anlam vermeye başlıyor” dedi. “Bu, diziden – doku yok, hücre yok – biyolojik bilgiye kadar önemli bir kavramsal adım ve gelecekteki birçok çalışmayı mümkün kılacak.”

Stanford’da biyoloji doçenti olan Hunter Fraser ve Fumitaka Inoue (UCSF) de makalenin ortak yazarlarıdır. Fraser ayrıca Stanford Bio-X, Anne ve Çocuk Sağlığı Araştırma Enstitüsü (MCHRI) ve Stanford Kanser Enstitüsü üyesidir. Petrov aynı zamanda Stanford Bio-X ve Anne ve Çocuk Sağlığı Araştırma Enstitüsü (MCHRI) üyesidir ve Stanford Woods Çevre Enstitüsü’ne bağlıdır.

Bu araştırma, Human Frontier, Rothschild ve Zuckerman bursları tarafından finanse edildi; Ulusal İnsan Genomu Araştırma Enstitüsü; Ulusal Ruh Sağlığı Enstitüsü; Uehara Memorial Vakfı; ve Stanford Hesaplamalı, Evrimsel ve İnsan Genomik Merkezi (CEHG).

İstanbul Haberleri

İstanbul'da yaşanan son dakika gelişmeleri, en güncel haberleri okuyucusuna sunan bağımsız yerel gazete. İstanbul Haberleri  

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir